Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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VEGFDO43915 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VEGFDO43915 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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