Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CTIFO43310 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CTIFO43310 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTIFO43310 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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