Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CRXO43186 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CRXO43186 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CRXO43186 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CRXO43186 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CRXO43186 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms