Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SOCS1O15524 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SOCS1O15524 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms