Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLOCKO15516 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLOCKO15516 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms