Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN34H7C241 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms