Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GOLGA8SH3BPF8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GOLGA8SH3BPF8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms