Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ODF3BA8MYP8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms