Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ZNF839A8K0R7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZNF839A8K0R7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms