Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms