Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MAP1LC3B2A6NCE7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MAP1LC3B2A6NCE7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms