Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF283-205ENST00000590950 466 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091132.5-201ENST00000590995 560 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM95B1-210ENST00000591605 743 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SQSTM1P1-201ENST00000603451 859 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233724.14-201ENST00000603531 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR941-5-201ENST00000621667 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 BSNDP2-201ENST00000621945 366 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR6511B2-201ENST00000636908 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR941-3-201ENST00000637366 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF648-201ENST00000339948 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006116.1-201ENST00000587908 2171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 EFCAB8-201ENST00000400522 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 HPSE-202ENST00000405413 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TNFRSF10B-201ENST00000276431 4146 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCN5-204ENST00000376108 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACSL6-204ENST00000379244 2658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GEMIN6-201ENST00000281950 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM94-209ENST00000579208 3543 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCAM-201ENST00000264036 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM32-201ENST00000373983 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GP2-203ENST00000381360 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACLY-203ENST00000393896 3682 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN29-202ENST00000396976 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 B3GALT5-202ENST00000380618 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CNTNAP2-201ENST00000361727 9896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 VIT-205ENST00000404084 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAF8-210ENST00000494547 2402 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC100827.4-201ENST00000563464 2441 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF225-204ENST00000590612 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC7A11-AS1-202ENST00000510767 4654 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 UHRF1-205ENST00000620565 3965 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SIK2-201ENST00000304987 9678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIGAR-204ENST00000635110 3633 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAQR7-201ENST00000374296 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MLLT3-209ENST00000629733 3264 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMBIM1-214ENST00000444881 2936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAREM1-202ENST00000399218 7033 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKP1-202ENST00000352845 2244 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PCDHGC5-201ENST00000252087 4761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 URB2-201ENST00000258243 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ERAP2-201ENST00000379904 3219 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGEF9-228ENST00000636926 5436 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLA2G4A-201ENST00000367466 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01015-203ENST00000434657 2874 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARHGAP44-201ENST00000262444 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC40-203ENST00000374877 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GULP1-202ENST00000409580 3544 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNE1-206ENST00000432085 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 EGFR-201ENST00000275493 9821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP2B2-204ENST00000397077 8964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST6-201ENST00000332272 7957 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 HMGCS1-202ENST00000433297 3466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACAN-208ENST00000561243 7593 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYNE1-237ENST00000539504 3768 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPIN2-201ENST00000261596 6229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SERAC1-202ENST00000367104 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms