Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 INPP5D-204ENST00000445964 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NOL11-201ENST00000253247 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DDR1-223ENST00000324771 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PARG-201ENST00000402038 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SCN8A-208ENST00000599343 5976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590483.3-201ENST00000623669 3580 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN2A2-201ENST00000360468 6268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NRAP-202ENST00000360478 5426 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027369.3-201ENST00000530465 3707 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA6-202ENST00000414478 5091 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SIRT5-204ENST00000397350 4382 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SPAG5-201ENST00000321765 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ACSF3-201ENST00000317447 3664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MIER1-203ENST00000357692 4978 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01141-203ENST00000426428 2993 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 BARD1-212ENST00000617164 5449 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SORD-201ENST00000267814 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM12B-208ENST00000627241 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIA1-208ENST00000518142 2761 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ASTN2-204ENST00000358637 3411 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AP001180.1-201ENST00000562202 3566 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAT-216ENST00000523399 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TEX10-201ENST00000374902 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105105.1-201ENST00000591360 2553 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV1-207ENST00000572705 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRR-201ENST00000283228 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP4-8-201ENST00000318329 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SCGB2B2-201ENST00000379204 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL357055.2-201ENST00000412567 434 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 GNAI2P2-201ENST00000417003 916 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC064862.1-201ENST00000421221 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073873.1-201ENST00000433950 276 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL824P-201ENST00000470692 297 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114300.1-201ENST00000502347 280 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT112P1-201ENST00000505515 351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01341-204ENST00000505748 595 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms