Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF14-201ENST00000581201 2931 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPH3A-201ENST00000389385 4679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBCD-201ENST00000355528 7168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 UTP15-201ENST00000296792 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 C9orf43-201ENST00000288462 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDLBP-203ENST00000391975 6372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MX1-203ENST00000398600 3470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIA1-205ENST00000433529 4647 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 EPB41L1-218ENST00000628415 3287 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SELP-206ENST00000458599 1945 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMAD9-203ENST00000399275 5389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC046168.1-201ENST00000561283 3814 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 GLDN-202ENST00000396399 4584 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEK6-201ENST00000320246 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRPV2-201ENST00000338560 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL3-221ENST00000455274 2848 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RBM19-202ENST00000392561 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABHD4-203ENST00000428304 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCOR-212ENST00000615339 2618 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ETF1-201ENST00000360541 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-240ENST00000638575 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-245ENST00000638759 3723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNMA1-264ENST00000639544 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXL2NB-201ENST00000383165 3538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL1RAP-212ENST00000443369 2760 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLIP1-213ENST00000540338 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DHX40-201ENST00000251241 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DAB2-202ENST00000339788 3690 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CR2-201ENST00000367057 4240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 BEND3-201ENST00000369042 6200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEFM-201ENST00000221166 4020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AGBL4-204ENST00000371839 2947 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSENEN-201ENST00000222266 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYL4-201ENST00000354968 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 CD300A-203ENST00000361933 382 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR671-201ENST00000390183 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR941-2-201ENST00000401322 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR941-4-201ENST00000401376 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC25A20P1-201ENST00000408043 903 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD88C-201ENST00000408061 91 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073957.1-201ENST00000418941 535 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC114489.1-201ENST00000421619 395 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX11L5-201ENST00000421620 654 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099670.1-201ENST00000455141 783 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL55-223ENST00000459783 694 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC234782.3-201ENST00000461229 433 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL27-203ENST00000503633 742 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL121988.1-201ENST00000542839 560 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003721.3-201ENST00000543275 405 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC133555.1-201ENST00000546408 259 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL32-225ENST00000548246 447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM181A-AS1-204ENST00000556290 526 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012653.1-201ENST00000558410 931 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC103810.2-201ENST00000577938 559 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC032019.1-201ENST00000579100 173 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC069061.2-201ENST00000580686 480 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.9 ms