Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8H2

KRTAP5-3, Keratin-associated protein 5-3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP5-3Q6L8H2 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC138932.4-201ENST00000619102 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RN7SL113P-201ENST00000619959 299 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC138969.4-201ENST00000620593 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC007347.2-201ENST00000623044 180 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PDE6B-201ENST00000255622 3280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LMX1A-202ENST00000342310 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ABI1-205ENST00000376139 3516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MEIS1-202ENST00000398506 3530 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 BRPF3-211ENST00000534400 4254 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 DLAT-201ENST00000280346 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 DNASE1-201ENST00000246949 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PLAA-201ENST00000397292 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SH2D4B-202ENST00000339284 3983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 BACH2-202ENST00000343122 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SKAP2-201ENST00000345317 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TLR10-202ENST00000361424 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NTRK3-220ENST00000626019 2741 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ODF2-203ENST00000372807 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 UTP23-201ENST00000309822 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PLEKHG5-208ENST00000400915 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SZRD1-202ENST00000401089 3447 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 LRIT2-202ENST00000538192 3177 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 C3orf67-206ENST00000472469 4108 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF45-204ENST00000589703 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SIRPA-201ENST00000356025 3867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ARHGEF3-202ENST00000338458 3639 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 BAG6-235ENST00000362049 3626 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 STRADA-231ENST00000638708 2153 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZKSCAN5-203ENST00000451158 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TRPS1-209ENST00000519674 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SYVN1-206ENST00000526060 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MATN1-201ENST00000373765 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 BCL6B-201ENST00000293805 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 DSG4-201ENST00000308128 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF544-213ENST00000599227 3587 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SYTL2-206ENST00000389960 4299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OARD1-210ENST00000479950 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 EZH1-217ENST00000590078 2392 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 COL6A3-205ENST00000392004 4037 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 IFT122-206ENST00000440957 4007 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 FOXP1-220ENST00000614176 6384 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SUPT5H-201ENST00000359191 3770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC009812.3-201ENST00000523871 3766 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GOLGA3-207ENST00000545875 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CAMTA2-201ENST00000348066 4491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 VIT-202ENST00000379242 2810 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SORBS3-201ENST00000240123 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 MROH7-201ENST00000339553 3459 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 APP-201ENST00000346798 3467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 PPP6C-201ENST00000373547 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
KRTAP5-3Q6L8H2 JAKMIP2-202ENST00000333010 2992 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms