Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC093802.1-201ENST00000407524 3238 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TCOF1-211ENST00000513346 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CARMIL1-201ENST00000329474 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 POM121L1P-201ENST00000402027 1934 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LASP1-203ENST00000433206 4023 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL031666.2-201ENST00000599904 2253 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37A3-201ENST00000319651 5537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PNPLA6-203ENST00000450331 4457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RHBDL3-203ENST00000536287 4470 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PIWIL2-202ENST00000454009 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CHMP1B-201ENST00000526991 3054 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKS1B-211ENST00000547776 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CACNA1S-201ENST00000362061 6166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP22-201ENST00000432801 1319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GOSR2-232ENST00000640051 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ELF5-202ENST00000312319 2450 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MYT1-205ENST00000622439 2140 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF141-201ENST00000265981 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP4A11-202ENST00000371904 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NAV1-203ENST00000367302 9685 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 UNC45B-203ENST00000591048 2553 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHB11-201ENST00000354757 4198 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 OTOG-201ENST00000342528 4992 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0141-202ENST00000432126 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SOX9-201ENST00000245479 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 BBS10-201ENST00000393262 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 WIPF3-203ENST00000409290 4002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 LASP1-201ENST00000318008 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC14-203ENST00000412756 4568 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GIT2-203ENST00000355312 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHG5-204ENST00000377732 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 GTF3C1-201ENST00000356183 7018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 FAH-204ENST00000539156 3427 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 SMIM19-204ENST00000438528 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP2-207ENST00000537442 2613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TCOF1-205ENST00000439160 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 TMC2-201ENST00000358864 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
KRTAP9-9Q9BYP9 MERTK-202ENST00000409780 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.1 ms