Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNX13Q9Y5W8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms