Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PAXBP1Q9Y5B6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PAXBP1Q9Y5B6 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms