Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED16Q9Y2X0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED16Q9Y2X0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MED16Q9Y2X0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MED16Q9Y2X0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MED16Q9Y2X0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms