Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEFF2Q9UIK5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms