Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APEX2Q9UBZ4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APEX2Q9UBZ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms