Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SCHIP1Q9P0W5 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms