Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV7

ZIM2, Zinc finger imprinted 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM2Q9NZV7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ZIM2Q9NZV7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms