Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DLL3Q9NYJ7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DLL3Q9NYJ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms