Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC39A9Q9NUM3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC39A9Q9NUM3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms