Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUK0

MBNL3, Muscleblind-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBNL3Q9NUK0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBNL3Q9NUK0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms