Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms