Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOMER2Q9NSB8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOMER2Q9NSB8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms