Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRQ5

SMCO4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO4Q9NRQ5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMCO4Q9NRQ5 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms