Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPHNQ9NQX3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPHNQ9NQX3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms