Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC31BQ9NQW1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC31BQ9NQW1 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms