Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TIMMDC1Q9NPL8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms