Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC8Q9H0W5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC8Q9H0W5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms