Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC90BQ9GZT6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms