Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
POLR2J2Q9GZM3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms