Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ROPN1BQ9BZX4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ROPN1BQ9BZX4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms