Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
C9orf16Q9BUW7 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
C9orf16Q9BUW7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms