Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CRACR2AQ9BSW2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms