Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SDF4Q9BRK5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SDF4Q9BRK5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms