Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SIN3AQ96ST3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SIN3AQ96ST3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms