Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCLT1Q96NL6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCLT1Q96NL6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCLT1Q96NL6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCLT1Q96NL6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SCLT1Q96NL6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCLT1Q96NL6 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms