Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
COG8Q96MW5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
COG8Q96MW5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms