Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PHACTR3Q96KR7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PHACTR3Q96KR7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms