Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PKNOX2Q96KN3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms