Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FBXO17Q96EF6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FBXO17Q96EF6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms