Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTHRC1Q96CG8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms