Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSR2Q969E8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSR2Q969E8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms