Protein–RNA interactions for Protein: Q92466

DDB2, DNA damage-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB2Q92466 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DDB2Q92466 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms