Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNX29Q8TEQ0 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNX29Q8TEQ0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms