Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCER1Q8TC90 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCER1Q8TC90 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER1Q8TC90 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER1Q8TC90 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER1Q8TC90 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCER1Q8TC90 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms